神无毗桥的战役，消耗火之国国力的无休止的战争为了切断土之国的补给线，阻止其侵略，木叶策划破坏神无毗桥。后来四代火影所率领的只有三个人的小队来负责这次作战。在敌人的猛攻中，虽然付出了宝贵的牺牲，可是成功了。漫长的战争也因此迈向终结。
九尾妖狐的袭来，柱间不在后，木叶的4次灭村危机未曾有过的袭击村子的大事件说是突如其来的惨剧，村子陷入毁灭的边缘，是意外的事故还是幕后黑手的精心策划、幽暗的深夜，暴戾的尾兽。四代火影赌上自己的性命，拯救了村子……
宇智波一族的灭亡，被许多谜团笼罩着的一族的惨剧，宇智波灭族的原因，被木叶高层隐藏的真相宇智波一族密谋谋反的事情已败露，为了保护木叶安危，木叶高层将要一举歼灭宇智波一族，而执行这项任务的人却是宇智波族人宇智波鼬。他诛杀了一族的人，却放过了自己的弟弟，仇恨，无休止的蔓延着……
毁灭木叶的计划，企图颠覆木叶的邪道和疯狂。师徒相弑！火之意志的传承！——三代之死篇大蛇丸谋划着摧毁木叶，和砂忍联手进攻木叶。木叶村集结全部力量，阻止了大蛇丸的野心。但是三代火影在与大蛇丸的战斗中壮烈牺牲……
五代火影的就任肩负起村子的是“传说中的三忍”中的一点红，纲手就任火影仪式，正式成为木叶村第五代火影被选为五代火影的是“传说中的三忍”中的纲手。随着新任火影的就任，百废待兴的村子也在渐渐恢复中。
佩恩六道的袭来，继十六年前九尾事件的又一幕惨剧。晓组织幕后人物“宇智波斑”实现“月之眼”计划而实施捕猎九尾的行动，木叶被佩恩六道夷为平地，但漩涡鸣人最终战胜强敌，并感化了长门，复活了死去的木叶忍者们，但三忍之一的自来也却永远离开了我们……
五影会谈的帷幕，第四次忍界大战的序曲。佩恩一役后，五代火影虚耗过度而昏迷，根之首领团藏代理火影，代表木叶参加五影会谈，波澜不惊的谈判桌上杀机暗藏，两双血红的眸子正虎视眈眈……
大战的爆发，决定忍者世界命运的战争。五影的会谈被两位不速之客打断，四影断然拒绝“宇智波斑”的“月之眼”计划。代理火影志村团藏仓皇出逃并败于被仇恨吞噬的宇智波佐助。以牺牲自己为代价的封印术失败后，在从前的回忆中，遗憾的闭上了眼睛，木叶一代元老走完了他悲剧、孤独而伟大的一生。同时空前的大战一触即发……
各自的忍道，宇智波一族的复仇者与火之意志的继承者。鸣人与佐助，终结谷之战佐助和鸣人，两个命运之子继终结之谷后再次相遇。各自成为一流忍者的两人互相了解了对方。背负了宇智波一族的荣耀和九尾妖狐力量的两人将如何引导忍者世界的发展。变革还是毁灭。生存还是死亡……
九尾妖狐的驯服，命运的预示和道路的指引。鸣人被蛤蟆大仙人从被变成废墟的木叶村通灵到妙木山，并告知了他的梦境，指引了鸣人修行的方向。在云忍村荒无人烟的无人岛，由八尾人柱力奇拉比指导，在鸣人母亲漩涡玖辛奈的帮助下，成功驯服了九尾，夺取的九尾的查克拉。同时潜藏在鲛肌里的晓组织成员干柿鬼鲛也以牺牲自己为代价，为面具男送出了情报。
木叶的有名小吃——木叶的一乐拉面很有名，看鸣人那爆食的样子，实在是有些嘴馋啊。再就是木叶的甜食也相当不错，什么糯米丸啊，红豆汤啊，纳豆啊。如果多买多吃，还有优惠券赠送呢，物超所值。木叶的风景——木叶山明水秀绝对是个旅游的好地方，可惜景点不多，除了火影石像外好像也没什么壮观的建筑了，不过在森林中烧烤也是个不错的选择。
初代火影千手柱间，千手柱间成为初代目火影，一国一村一影体系制度获得高度评价，世界各国相继效仿。千手柱间联姻涡之国村长漩涡水户，为体现两国友好下令木叶高层服装后背印上漩涡一族的标记。宇智波斑在石碑前诀别千手柱间离开木叶村，寻找“真正的梦想”。第一次五影大会开始，宇智波斑穿戴木叶护额以木叶高层身份阻止无和大野木前往木叶实施外交。劝说岩隐臣服于木叶。以压倒性实力打败无和大野木。使大野木迷失了自我。宇智波斑使用万花筒写轮眼驯服九尾带领九尾对木叶发动袭击。柱间为了保护木叶与斑展开终结之战，终结之战中千手柱间在与斑的对决中无意间打出了终末之谷，终结之战结束柱间最终胜利，打败并“杀死”曾经的朋友宇智波斑暂时守护了木叶和平。黑绝在山崖目睹了全过程。终结之战后柱间打败斑并且收服了九尾，水户为了协助柱间，将九尾封印在自己体内成为了九尾的首位人柱力。此次九尾成为了木叶的尾兽。宇智波斑的尸体被扉间藏进了木叶的深山。柱间杀死斑的大峡谷被后世称为终末之谷，木叶为了纪念这次大战在终末之谷瀑布两边修建了二人的雕像。斑提前在右眼设置了转写封印以失明为代价使用了伊邪那岐改写现实成功复活。并且让影分身伪装成尸体。移植柱间细胞后开启轮回眼。召唤外道魔像培养白绝。靠外道魔像输送查克拉维持生命。但他不知道其实他的一切都是黑绝在暗处设计并且默默操纵着。泷隐之村中的精英角都，接受了高层派下来暗杀初代火影的任务，在潜入火之国境内后角都便与初代火影柱间展开对战，最终败在柱间的木遁秘术之下，遭到丧命危机。若干年后柱间去世，扉间继承火影
二代火影千手扉间，柱间去世，扉间继承火影。创立暗部，加强中央集权。建立忍者学校。扉间重视传承建立忍者学校及中忍考试制度培育人才。成立木叶警务部队由宇智波一族担任。为了防止下一个斑出现，千手扉间决定整合与引导宇智波的力量，他将警务部与监狱建在一起，让宇智波一族负责维护村子的治安，使宇智波一族为村子做贡献。扉间培育了猿飞日斩，志村团藏，宇智波镜，水户门炎，转寝小春，古介等38个毕业生。扉间的这些学生后来都成为了木叶村的核心人物。第一次忍界大战爆发，扉间与弟子前往云隐村与二代雷影实施结盟。金角银角在云隐村二代雷影与二代火影的结盟仪式上突然掀起政变。二人以六道忍具和九尾查克拉的力量，弑杀二代目雷影并且让扉间受到了濒临死亡的重伤。第一次忍界大战之后，扉间与部下猿飞日斩、水户门炎、转寝小春、志村团藏、秋道取风、宇智波镜一同被大约有20人的金角部队追击，众人商量需要让其中一个人担当诱饵来引诱敌军，以保证其他队友能够有时间顺利逃脱。扉间为选择正确的继承人而暗中考验着部下。团藏虽然抱持着想要自告奋勇担当诱饵的心念，但在关键时刻却因胆怯而没有说出。此时日斩挺身而出，提出让自己担当诱饵。最终扉间为了木叶隐村的未来而决定亲自担当诱饵，临行前对日斩的行为表示赞许，并授命日斩成为下一代的火影，之后便因掩护日斩等人而牺牲。