这次暖阁召对，杨廷和逆了龙鳞，皇帝对他做了脸色。很快就有御史言官嗅出味道，上奏弹劾杨廷和，言辞锋利，咄咄逼人。杨廷和不得已，只能和御史辩论起来。结果皇帝在旁冷冷地看着，显然是在借言官之手，杀杨廷和的威风。
杨廷和在朝廷里混了一辈子，什么不明白？回到府里琢磨了一夜，即上奏章请求致仕。但这时候嘉靖皇帝还没把杨廷和搞臭，要让他走了，倒说不清了，于是下旨安慰，不准首辅致仕。为了抚慰杨廷和，甚至做出姿态，把弹劾杨廷和的御史下狱论罪。
当然，也没论什么罪，做个样子罢了。
眼看皇帝要对自己下手，杨廷和身为臣子，毫无力量，唯一能做的就是称病在家，不入内阁办事。
眼看首辅站不住脚了，内阁两位元辅蒋冕、毛纪也都学着杨廷和的样子称病在家，不再入阁办公，一时间，朝政又陷入了僵局。
到这时候，嘉靖皇帝和内阁元辅们已经从共商国是，转入了互相较量。可朱厚熜毕竟是藩王世子入嗣的，在根基上不是那么扎实，年纪又轻，登极时间又短。内阁三位老臣都在朝多年，根深蒂固。如今三个老臣一起称病，倒让皇帝十分难堪，终于还是下旨慰问，杨廷和这才勉强入阁办公。
但到这时候很多人都已经看出来，皇帝是要撤换这几个内阁老臣了。
现在，又到了小人们露出头来的时候了。
那个已经被赶到南京去做刑部主事的张璁，在南京遇上了同样正在充任刑部主事的江西人桂萼，俩人立刻结成一党，又瞧准了机会开始上疏奏请再议“大礼”，以朱厚熜的生父兴献帝为“皇考”。眼看是个机会，湖广巡抚席书和吏部员外郎方献夫也赶紧出来表态，一起支持皇帝。
有了这些人的支持，朱厚熜的势力渐渐滋长，他已经用不着再给内阁留什么脸面了。
嘉靖三年二月，已经再也混不下去的内阁首辅杨廷和再次上奏请求致仕，嘉靖皇帝立刻接受，把这个为官四十六年，入阁前后十八载的老臣赶出了京城。
杨廷和一走，内阁立刻失势，张璁、桂萼等人上疏请求议礼。这时候多数朝臣仍然反对议礼，可嘉靖皇帝既然连杨廷和的面子也不给，又哪会顾及别人的面子，对反对的臣子一律罚俸！
眼看着斗不过皇帝了，臣子们只好认输，答应给嘉靖皇帝的生父兴献帝的尊号里加一个“皇”字，变成兴献皇帝。
可惜，此时朱厚熜的要求已经不止于此了。他现在要奉自己的父亲为正统，把孝宗皇帝、武宗皇帝踢到一旁去。
于是还在南京当着刑部主事的张璁立刻又上奏折，说：“今之加称，不在皇与不皇，实在考与不考！”朱厚熜龙颜大悦，立刻命张璁、桂萼、席书进京，准备让他们和方献夫等人结成一党，对抗那些反对议礼的朝臣。
到这时候，嘉靖皇帝已经做好了充分的心理准备，要用张璁、桂萼、席书这几个人替换内阁重臣。于是再次召见阁臣，商议“大礼”。此时已经成了首辅的蒋冕仍然坚决不肯，礼部尚书汪俊也上奏力谏。嘉靖皇帝立刻下旨罢了汪俊的官，由席书接任礼部尚书，之后又罢了蒋冕，把这个刚接任的首辅逐出京城。
嘉靖三年六月，张璁、桂萼回到京城，结果又传出消息，说朝中旧臣们要私下打死张璁、桂萼这几个人。消息一传出来，嘉靖皇帝立刻绕过内阁降下一道内旨，直接升任张璁、桂萼为翰林学士，方献夫升任侍讲学士。
到现在，朱厚熜父亲的尊号已经变成了“本生皇考恭穆献皇帝”，母亲兴国太后为“本生母章圣皇太后”。只要再想办法把那多余的“本生”两个字去掉，朱厚熜就可以让自己的亲生父亲挤进祖庙，把孝宗皇帝朱祐樘扔到一边儿，以自己的亲生父亲为正统奉祭了。
年轻的嘉靖皇帝已经成熟了，搞臭打倒，暗中授意，破格提拔，直降内旨……这一套皇帝收拾臣子的手段，他都已经学会了，只差最后一条他还没学到手——也可能已经学到手了，只是还没机会使出来，那就是：出动锦衣卫，对大臣一体清算，格打捕杀。
很快，张璁、桂萼二人又上奏章，找出理由驳斥“本生”二字。嘉靖皇帝立刻以此奏为由，命内阁大学士毛纪删去册文中“本生”二字。毛纪仍然不肯答应，朱厚熜大怒，厉声呵斥毛纪：“‘君父’二字是纲常大理，万古不异！你等眼里无君，还想让朕也没有父亲吗？”随即下诏命群臣到左顺门，宣诏为自己的生母章圣皇太后去“本生”二字。