木遁忍术：初代火影·千手柱间独创的秘术。该术属于血继限界的一种，由土、水两种属性查克拉合成。这是施术者以自己的查克拉当作生命之源而发动的忍术，从地上快速生长出多棵树木，在一瞬间内就能制造出一片森林，森林内的树木的一切攻防均由施术者操控，并且有利于施术者施展其它木遁忍术。这类忍术的特点是结印的最后一个印为巳之印。
火遁忍术：基于查克拉五大基础性质变化之一的“火”属性查克拉施展的忍术，该术是将查克拉聚集在喉咙后，从口中喷吐火焰进行攻击，特征是结印最后通常以“寅”印结尾。可以克制风遁，但被水遁克制。
水遁忍术：五大性质当中的其中一种，即忍术的一个系。通过凝聚水属性查克拉来进行攻击或者防御，一般是操纵附近的水分来施展此术，出色的水遁忍者可以无水之地施展。
风遁忍术：五大性质的其中一种，即忍术的一个系。该术是通过凝聚风属性查克拉来进行攻击或者防御，具有切割效果，在近身战斗中，施术者可以将风遁查克拉注入到忍具上使用（例如猿飞阿斯玛）。风遁的特征是结印最后通常以“辰”印结尾。在原著漫画中，风属性忍者很少见。风遁能够以切割力打败雷，但能放大火遁的效果。
土遁忍术：五大性质的其中一种，即忍术的一个系。该术是通过结印方式将土属性查克拉灌入地面进行攻击或者防御，特征是结印最后通常以“巳”印结尾，和雷遁相比在劣势，和水遁相比在优势。土遁忍术是岩隐村最擅长的忍术之一，除了土影以外，村子中的人也大多擅长土遁，赤土、黄土等更是其中的佼佼者。
雷遁忍术：五大性质的其中一种，即忍术的一个系。该术是将雷属性查克拉集中在手掌形成高强度电流来进行攻击或者防御，在近身战斗中，施术者可以将雷遁查克拉注入到忍具上使用（例如宇智波佐助、八尾人柱力·奇拉比）。雷遁克制土遁，但被风遁克制。
以上五种属性的遁术，就是忍界常见的五行属性。
在此之上还能够两两融合，亦或是三者相结合，来造就血继限界或者是更高层次的血继网罗。
血继限界：一种只能由血缘关系借由基因来继承的术。通常除了同血脉的人可以继承之外，其他人无法习得，即使使用写轮眼也无法复制。血继限界使用者拥有特殊的能力，各大国和忍者村对此都十分重视。一方面保护己方族群的血继限界不被外人所知，另一方面刺探或破坏敌人的血继限界。由于血继限界由血缘传递的特殊性，它常常给家族带来战争、不幸甚至是灭族的危险。并且有部分的血继限界有副作用（比如说万花筒写轮眼）。
其一，查克拉的性质变化分为：火、风、雷、土、水、阳、阴共七种。当两种查克拉性质变化融合就会产生新的遁术，称之为“血继限界”。例如：风+水=冰、土+水=木，相同的两种属性融合后的新属性不一定相同。通常只有极少数的忍者可以自己开发出这种新的遁术。一旦成功，这种新的遁术就会被忍者的基因记录下来，通过血缘关系传给自己的下一代。
“木”代表森之千手一族（千手一族领袖千手柱间拥有木遁的血继限界），“叶”代表宇智波一族（宇智波一族族徽外形是扇叶）。木叶村的整体是个扇形，当任何人走进木叶时，第一眼就会看到矗立在木叶最高峰的历代火影的石像。前四位已经逝世的火影的石像就被雕刻在木叶山上，第五代火影纲手的石像在鸣人随自来也外出修炼的途中也雕刻好，第四次忍界大战之后六代目火影旗木卡卡西、七代目火影漩涡鸣人的石像也分别被刻在火影岩上。他们都是传说中最强的忍者，都是为了木叶忍者村的兴旺和繁荣而献出生命的英雄，也许他们的名字并不被我们熟悉，但他们所流下来的火影精神却世世代代都会在人们的心中永存。木叶忍者村全盛时期为第三代火影时期（来源于木叶村的两位顾问水户门炎和转寝小春在得知团藏死去的消息后的对话，“当年日斩在明，团藏在暗，他们俩共同构建了木叶全盛时期，现如今就只剩下我们俩了”。）
在原剧情中，历代火影初代火影：千手柱间，二代目火影：千手扉间，三代目火影：猿飞日斩，四代目火影：波风水门，五代目火影：纲手，代理火影：志村团藏，六代目火影：旗木卡卡西，七代目火影：漩涡鸣人。
火影石像是木叶的标志，在木叶山顶这里可以俯看整个木叶，木叶有非常完善的体制，称之为火之体系。木叶已知有六个较大的部门，这六大部门运行着木叶的各项工作，使木叶充满着勃勃生机。
暗部，由第二代火影·千手扉间所建立的暗杀战术特殊部队，简称暗部，由火影直接指挥。暗部的成员都是从村子里筛选出的优秀忍者，主要进行保护火影和预防外敌侵入木叶忍者村的工作，有时还负责侦察敌情和暗杀等任务，其成员行动时都戴着模仿动物的白色面具，任务性质及其他一切资料均保密。暗部由火影直属，部队底下设多个分队，由分队长统一传达命令和领导执行任务。
根，由志村团藏建立并指挥的一个神秘组织。又称“暗部培训部门”，是指所谓的暗部特别机动部队，直接隶属于木叶元老志村团藏的独立组织，既不受火影的管制，也不受暗部所管辖，制服是白色或黑色披风。从疾风传·卡卡西暗部篇中得知，在九尾事件至宇智波灭族事件期间，该组织的活动相当活跃，在木叶发挥着独特作用。
根组织比暗部隐藏得更深，所做的事也更加见不得光。团藏和根成为了木叶最直接有效的利剑，以“宁错杀，不放过”的姿态铲除村内外一切威胁。但由于三代火影无法容忍志村团藏将人培养成杀人机器的行为，在宇智波灭族事件之后，下令解除团藏“火影辅佐”的职务，并下令“根”解散，虽然“根”在宇智波灭族事件后就已经解散，但仍有不少前成员继续在暗部任职，甚至效忠于“根”。在疾风传中，该组织再次出现，估计是得到木叶两位顾问的支持，得以继续重组。从疾风传动画版中可以看出，“根”成员佩戴的面具比火影直属暗部的面具要更加丰富多彩，并不只限于仿照动物的面部进行设计。
行政部，辅助火影管理木叶政务的机构，其最高长官是作为原三代火影顾问的水户门炎和转寝小春两位老师，他们的地位相当于村中的长老，行政部的存在也是木叶的立法形式之一。一来是为了辅助火影工作给予一些正确性的意见，二来是作为火之国与木叶的桥梁，传达国家的信息，及接受国家所拨给村子的财政支出，同时也向大名反应村子的一些状况和形势。
医疗部，木叶原本的医疗部并不发达，但由于三忍之一的纲手提出的四人战斗小队中配一名医疗忍者的历史性方案使的木叶的医疗部有了突飞猛进的发展，时至今日已经可以分成急救医疗班，尸体处理班，驯兽疗养班等多个分支系统。医疗急救班——主要负责医治因任务或事故而受重伤的忍者的单位，其成员都是擅长医疗忍术的精英，执行任务时都穿着白色的专用医疗服（就是中忍考试中的那些抬担架的人，237话中医治宁次时也出现过）。许多升级为上忍的医疗忍者大多都是出生于医疗急救班，而其班长便是兜的养母（分析兜的实力就应该了解医疗班的强悍了）。尸体处理班——专门负责处理死亡尸体的单位，由于忍者的身体会透露出每个忍者村特有忍术的秘密和查克拉性质，还有用过特殊药品成分的痕迹，所以为了保护这些情报必须有专业人员来负责工作，尸体处理班不但清理村子内出现的尸体而且还定期向暗部输送优秀人才，以帮助处理一些本村逃忍的尸体。（注：兜在于卡卡西一战时所使用的死魂术源于处理班）训兽疗养班——主要工作就是医治一些受伤的驯兽（赤丸那类）和宠物（豚豚那类）的单位，成员大多都是兽医（牙的姐姐便是其成员，有可能是训兽疗养班的班长），由于驯兽大多都是和主人一起执行任务的受伤也是在所难免，所以训兽疗养班的存在也是非常必要的。
教育部，为了保障意志的传承，以及确保教育稳定性和人才培养效率，第二代火影扉间建立木叶忍者学校，并培养出以猿飞日斩、志村团藏、宇智波镜、秋道取风、水户门炎、转寝小春、丸星古介为代表的38名学生。而千手扉间的这些学生也是当时木叶最核心的一批人。这里是每一位忍者的摇篮之地，许多优秀的忍者就是从这里开始他们的忍者之路。在这里有每一位忍者的童年，也许是快乐的，也许是悲伤的，也许是烦恼的，也许艰辛的，酸甜苦辣充实着忍者的内心，人们爱着这里的同学也爱着这里的老师。这里曾经有着爱恶作剧的鸣人，爱美的小樱，爱耍酷的佐助，爱努力的小李，爱冷漠的宁次，爱吵嘴的井野，爱吃的丁次，爱睡觉的牙，爱嫌麻烦的鹿丸，爱极早毕业的鼬与卡卡西，和爱在脸上挂条倒疤的伊鲁卡。总之，这里有太多太多的回忆。
解析班，山中亥一是木叶解析班的部长，拥有对木叶解析班的绝对领导权，他带领着独乐迥、飞竹蜻蜓、圣志门等木叶解析班成员为木叶村做出了巨大的贡献。他们通常一起使用读心之术进入敌人的脑中窥其记忆而读取情报。
审讯部监狱，正式名称为木叶拷问审问部。专门执行对被捕的敌国忍者（特别是奸细）及一些逃忍监控拷问的部门，由于上述任务大多是由暗部负责所以此部门经常与暗部连立，审问所得情报不透露给机构与个人，直接交于火影。森乃伊比喜担任审问部的部长，带领着钢子铁、神月出云等木叶拷问部成员执行任务。
木叶警务部，由第二代火影·千手扉间所建立的木叶警务部队，由宇智波一族的人担任，负责维护村子的治安。这既是表达了二代目火影对宇智波的信任，同时也可以观察宇智波的一举一动。木叶警务部队的建立，让宇智波一族的名望、权利在木叶达到了顶峰。由于宇智波一族因灭族的原因导致木叶警务部队解散。在续作《博人传》中，木叶再次恢复警务部队，由一个名叫风魔光太郎的忍者担任队长。木叶警务部的标志就是手里剑中央刻有宇智波一族的家徽——火之团扇。亦代表了宇智波一族的光荣。但由于后来宇智波一族惨遭灭门的原因，使木叶警务部不再属于宇智波，因此木叶警务部标志中的火之团扇变更为木叶村标志。主要工作就是维持木叶忍者村内部的治安和稳定，负责制定村中的规律，加强、维持木叶隐村的秩序及治安，及逮捕有犯罪倾向的人、忍者（但不包括火影直属的暗部）。有时也支援暗部参加村子的警备工作。不过警务部队的职权也有限，例如涉及暗部的事情，他们是无法插手。
但是在这一世，木叶警务部队被宇智波止水牢牢控制住在手中。并且木叶警务部队的整体实力得到了进一步的扩张跟提升。
名门望族，看了木叶的六大部门是否觉得木叶的体系相当完备呢。其实木叶除了体系众多外各个家族也是多不胜数，许多名门望族也随之构成了一道靓丽的风景线。首先是木叶的两大血继名门——日向一族和宇智波一族。以及千手一族。其次是秘术族油女一族，犬冢一族。还有秋道一族，奈良一族，山中一族，猿飞一族，漩涡一族。